Muhammet Emin Canlı, İstanbul Şehir Üniversitesi İslami İlimler Fakültesi'nden mezun oldu (2017). Aynı üniversitenin Temel İslam Bilimleri bölümünde fıkıh alanında "Memlük Kahiresi Hanefî çevresi" adlı yüksek lisans tezini 2020 yılında tamamlamıştır.